55小说网

手机浏览器扫描二维码访问

六常见精神障碍的分子遗传学研究进展(第2页)

(一)双生子法

经典的双生子研究运用单卵(monozygosity,MZ)和异卵(dizygosity,DZ)双生子的信息来解决遗传和环境因素对一个性状的影响。双生子研究有两种不同的类型,一种是通过患病先证者收集的双生子,一种是基于人群的双生子登记系统。前者适用于探索一些相对罕见的疾病,后者更适用于研究常见性状和定量的表型。无论何种方法,他们都基于相同的双生子研究的基本原理,阐述如下。

1.群体遗传和双生子研究方法

根据群体遗传学(Biometricalgenetic)的理论,可以根据观测到的双生子表型写出关于遗传和环境的结构方程。通过对比家族成员之间观测到的和预期的相关性,可以预测出遗传和环境在其中发挥的作用。在行为遗传学中,遗传和环境的变量有以下几种。

(1)加性基因效应(additivegeneticinfluence,A),指所有影响表型基因座的等位基因效果总和。

(2)非加性基因效应(non-additivegeneticinfluence),指相同基因座等位基因之间的相互作用,包括显性基因(dominance,D),或不同基因座之间的相互作用。

(3)家庭成员共同分享的环境因素,简称共享环境因素(monenvironmentalinfluences,C),如家庭的社会经济因素、父母教养方式或饮食习惯等同时对两个双生子产生相同作用的因素。

(4)个体特异性环境因素(uniqueenvironmentalinfluences,E),指对同一个双生子家庭中两个体产生不同影响的因素。如遭遇特殊事件、父母态度不同,并且包括了测量误差。

综上所述,表型的总方差(VT)可以表示为VT=VA+VC+VD+VE。因为在MZ和DZ双生子中,A和D有不同程度的相关,而C和E相关程度相同,故双生子资料可以估计不同因素贡献的方差。在MZ双生子中,A和D因素的相关性均为1,而在DZ双生子中分别为12和14。MZ和DZ双生子的C因素相关性均为1,而E因素不相关。MZ双生子之间的差别完全是由个体特异性环境因素的造成的,两个体之间的相关即由基因和共享环境因素贡献的。因此根据Falconer规则:

DZ双生子表型之间的差异来自于基因和环境两个方面。在一起成长的双生子中,除了基因的影响,共享的环境因素也会使两者表型趋于相同。

与DZ对相比,MZ对之间的相关性更大。因此同时得到MZ和DZ双生子的信息可以从表型的个体差异中找到表型之后隐藏的基因或环境因素。根据双生子的关系式①和②,可以得出遗传和环境因素作用的大小:

如果考虑D因素而不是C因素,则

表型之间的相关系数可以初步提示遗传和环境之间的关系。对于相同表型的双生子对应的系数,可以发现,如:

rmz=rdz,则仅有E作用

2×rdz>rmz>rdz,则A,C和E起作用;

rmz>2×rdz,则A,D和E均起作用。

在双生子分析传统的结构方程单变量模型中,往往假设可观察到的表型是受到加性基因A、显性基因D、共享环境C和独特的环境E这些潜变量的影响。但是由于单变量模型里面总共只有三个统计量:表型方差、同卵双生子不同个体之间的协方差和异卵双生子不同个体之间的协方差,所以要使得单变量结构方程模型可解,最多只能有三个待定参数。一般的做法是在显性遗传D和共享环境C之间选择一个进行估计。

在现代的遗传学研究中,遗传度分为狭义遗传度(narrow-senseheritability)和广义遗传度(broadsenseheritability)。前者是指表型方差中加性基因方差的百分比,后者指所有遗传因素对表型方差的贡献,包括加性基因、显性基因、上位基因(epistatic),以及父母表型对个体的直接影响(maternalandpaternaleffects)。如果选择估计共享环境C,则可以计算狭义遗传度,

h

2

=VAVT。

2.双生子分析的假设

经典的双生子法有很多假设。重要的是这些假设的含义以及它们和性状之间的现实意义。双生子方法的假设包括:

第一是随机婚配,也就是不存在相似遗传背景的个体间婚配。正是由于这个假设,后面关于异卵双生子遗传因素在不同个体间的相关才能合理设置为0.5。

第二是相同的环境。共享的环境对MZ和DZ双生子影响程度相同。

第三是遗传和环境的交互作用。假设遗传和环境之间不存在相互影响,可直接观察到的表型变量和代表遗传因素的潜变量,代表共享环境的潜变量和代表独有环境的潜变量之间存在线性关系。

第四是就进行研究的表型而言,双生子与普通人群没有区别。

(二)分析方法

1.结构方程和通路分析

结构方程模型是由SewellWright(1921)首先提出。这一方法目前已成为一种双生子研究的标准方法。它可以同时拟合一系列的线性结构方程,找到与观察数据的方差、协方差相匹配的遗传和环境参数,其工作原理见图2-10。结构方程拟合的过程包括构建、拟合、评价和修正。在建立模型时,从生物遗传学的角度对方差的来源提出假设,通过通径法则或者协方差代数矩阵得到预测的方差协方差模型;同时,从已知的双生子数据,得到实际的方差协方差模型,用结构方程模型对预测的和实际的方差协方差模型进行拟合。在构建模型时必须充分考虑变量间关系。同时需考虑不同模型的意义,考虑指标误差项相关的意义。

通路分析方法在可视化和图示方面有先天的优势,可以清楚地通过图例把变量表型和目标变量之间的因果和相关关系展示出来。图2-11是一个完整的单变量双生子模型,两个双生子的观测表型数据表示为方块中,不可观测的变量、潜变量,则表示在圆圈中,如遗传和环境因素变量。因果关系有单箭头来表示,从潜变量指向观测变量。估计的路径值(即回归系数)表示潜变量对观测变量的作用,用a、c、d和e表示。潜变量之间的双箭头则表示它们之间的相关系数。

图2-10结构方程模型拟合过程

图2-11双生子单变量表型的相关通径图

加性遗传效应(A)和非加性遗传效应(D)在MZ双生子中相关系数为1,在DZ双生子中相关系数分别为0.5和0.25;家庭成员共同分享的环境因素(C)的相关系数在MZ和DZ中均为1,因为他们在相同的家庭中成长;个体特异环境因素(E)在MZ和DZ中均不相关,是同一个家庭不同成员之间表型方差的来源。a、d、c、e分别为A、D、C、E相应的负载系数。

结构方程模型(structuralequationmodelling,SEM)可以充分利用矩阵的性质和统计方法的特点,使用数据将具体的分析量化。比如可以将表型和某个感兴趣的基因之间的因果关系赋予一个合理的权值,这将使得随后的研究工作有据可依和更加严谨。

SEM程序包括了矩阵计算和数据的优化过程,比如Mx、LISREL、Mplus和AMOS。其中Mx是广泛应用于双生子分析设计的免费软件,它有灵活的处理模型拟合功能,可以绘制通径图,并在FORTRAN平台上进行模型优化和矩阵代数的计算。目前,开发者进一步升级到采用R平台的Open-Mx。

在OpenMx软件中,原始数据和协方差矩阵都可以作为输入的数据,运用全信息极大似然估计(fullinformationmaximumlikelihood,FIML)对参数进行估计,比如A、C、D和E的路径值。同时,原始数据的缺失值可以在全信息极大似然估计的过程中自动处理。

SEM软件采用最小对数似然函数对模型进行优化,利用似然函数(minus2loglikelihood,-2LL)作为拟合优度的目标指数。依赖该指标判断哪一个模型更好的拟合了原始数据。除了-2LL,另外一些指标也可以帮助我们判断模型的拟合优度,比如AkaikesInformationCriteria(AIC)。采用拟合指数最好的模型作为最佳模型,估计其参数。

OpenMx可以比较模型拟合的好坏。模型相对于饱和模型(saturatedmodel)的拟合优度似然比是服从卡方分布的,所以可以设置显著性水平对模型之间的差异进行卡方检验。这里所谓完美拟合的饱和模型是指所有的协方差均自由估计,所以他们的最大似然估计值即是样本的协方差。没有显著差异的卡方值表示模型和他们的数据一致,相反则表示模型对数据的拟合不理想。这个模型并不能反映实际的情况,所以不应该采用该模型。卡方检验的自由度等于实际观测到的统计量的数量(通常就是样本方差和协方差的数量)减去模型中需要估计的参数的个数。

2.多元回归分析

太平里的广记  中国皇帝全传  李俊峰  明代社会生活史  实用小儿学(第3版)  团体心理咨询与治疗  穿成女配决心好好当团宠  平凡不平凡的世界  空军武器大百科  财智在线,萧爷总是夸夸妻谈  覆雪归春  全球进入异世界  刘寅传  全面崛起  拿破仑传(全新升级版)  曾国藩全书  诗经全集  中年了不能玩游戏吗  神级龙珠系统  位面三国争霸  

热门小说推荐
燃婚前妻

燃婚前妻

她和他之间,从未有过爱情。为了家族利益,她被送到了他的面前,成为他的妻子。这段婚姻从未带给她任何的温情,有的只是世界上最冷漠的对待。她所有的期待,对于婚姻的美好向往,都在这噬骨得痛中被消磨殆尽当千帆过进,彼此的距离越来越远,心高气傲的他终于明白谁才是自己的真爱,便开启漫漫追妻之路!...

超牛管理员

超牛管理员

第六百三十九章幸福生活(大结局)  以前的那些个古代的人,无论如何也想象不到现在的社会能够发展到如此的境地,他们永远都不会想象到,现在的人们能够有着这样的生活...

亲手打造一个豪门

亲手打造一个豪门

资产千亿的霍家继承人霍不凡,被谋杀后重生在了一个底层男子的身上。在头疼如何面对这对不知情的母女时,霍不凡发现真凶已经将他的替身推至台前,意图窃取霍家的资产。唯一的办法,就是扎根于这个近乎破裂的家庭,从零开始,快速崛起,与幕后真凶抢时间。可是,万一时间长和这个漂亮到极点的老婆处出感情怎么办?护爸狂魔的可爱闺女不解的昂起头爸爸,你怎么不跟妈妈一起睡了?...

影视武侠

影视武侠

你愿意用你的生命去赌博吗?当一个长着两支恶魔角的美女出现在你面前的时候,你又该如何?韩文无奈的叹了口气我真后悔去年买了这块表!以影视中改编的武侠剧为主要版本,如陆小凤系列锦衣卫四大名捕天龙八部大旗英雄传顺序未定PS1可能穿插一些原著观点,考据党勿喷PS2绝非第一人称,因为第一章开头,估计很多人会误会PS3坑深慎入,温水煮蛤蟆,慢热PS4这是一个无限穿越的故事,也可以分成独立的小故事,不影响整体阅读,也可以分开来看,不妨先收藏下试试看,可能后边还有你喜欢的Ps5推荐最恶时代...

顶级团宠:大小姐她又野又傲娇

顶级团宠:大小姐她又野又傲娇

书海阁小说网免费提供作者南木溪溪的经典小说顶级团宠大小姐她又野又傲娇最新章节全文阅读服务本站更新及时无弹窗广告欢迎光临wwwshgtw观看小说邢颜这辈子也没有想到,自己有一天会勾搭上富可敌国的商业巨头薄琛。原以为是临时的救命稻草,可就在自己带球打算功成身退时,男人大手一挥,封锁了所有可以出国的飞机航班,并且在所有记者面前单膝下跪,薄太太,我道歉,昨晚是为夫知错了。众人一脸茫然。邢颜惊愕到咬牙切齿,薄先生,我们离婚了!!是离婚了,可你忘了带齐你的东西,男人低沉一笑,车归你,房子归你,孩子归你,我,也归你。邢颜吓得连连后退,...

战神归隐:七个姐姐绝色倾城叶羽洛诗雅

战神归隐:七个姐姐绝色倾城叶羽洛诗雅

养父入赘亿万富婆家吃软饭…身为天龙殿龙主的叶羽表示十分无奈,平白无故的多出七个绝色倾城的姐姐出来五姐叶羽弟弟,你老爸是个小白脸入赘了,你要是不听话,我们几个姐姐可会挨个挨个的修理死你哦。三姐小弟,这条蕾丝袜今晚必须给我吹干净哦,明天姐姐要穿呢…大姐小弟,十万火急,带苏妃速来公司!五姐小弟,姐姐腰疼,你会按摩吗?...

每日热搜小说推荐